میکروسکوپ کانفوکال، روشی اپتیکی برای تصویربرداری است که رزولوشن و کنتراست اپتیکی تصویر را افزایش می دهد. این افزایش به گونه ای است که با قرار دادن pinhole در صفحه ی کانونی نور های خارج از فوکوس حذف میشود.
در نتیجه این قابلیت به میکروسکوپ کانفوکال این اجازه را میدهد تا با اسکن کردن نمونه در عمق های متفاوت، تصویری از ساختار سه بعدی نمونه را تشکیل دهد.
همچنین این روش تصویربرداری، به افزایش رزولوشن و کیفیت تصویر به خصوص در راستای عمق نمونه کمک میکند.